library(tidyverse)
library(targets)
library(kableExtra)
Leaf disc vs whole-leaf
LMA (species-level)
Pooled
Seprated
SMA table
(species-level)
tar_load(sma_tab)
sma_tab |>
kable() |>
kable_styling()
|
Data
|
Slope
|
Intercept
|
R2
|
|
All
|
0.97 [0.94, 1.01]
|
0.09 [0.02, 0.16]
|
0.87
|
|
Thick~Large
|
0.93 [0.85, 1.03]
|
0.19 [0.01, 0.37]
|
0.86
|
|
Thick~Small
|
1.02 [0.97, 1.07]
|
0 [-0.11, 0.11]
|
0.93
|
|
Thin~Large
|
0.91 [0.82, 1.02]
|
0.2 [0.02, 0.37]
|
0.71
|
|
Thin~Small
|
0.93 [0.83, 1.03]
|
0.16 [-0.02, 0.35]
|
0.84
|
Leaf disc vs whole-leaf
LMA (individual-level)
Divergence
(species-level)
LMA and LD
(species-level)
CV
Leaf support cost
(species-level)
Computing
Environment
devtools::session_info()
#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
#> setting value
#> version R version 4.1.3 (2022-03-10)
#> os macOS Monterey 12.3
#> system aarch64, darwin21.3.0
#> ui unknown
#> language (EN)
#> collate en_US.UTF-8
#> ctype en_US.UTF-8
#> tz Asia/Shanghai
#> date 2022-04-06
#>
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
#> package * version date lib source
#> abind 1.4-5 2016-07-21 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> assertthat 0.2.1 2019-03-21 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> backports 1.2.1 2020-12-09 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> base64url 1.4 2018-05-14 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> broom 0.7.10 2021-10-31 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> bslib 0.2.5.1 2021-05-18 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> cachem 1.0.5 2021-05-15 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> callr 3.7.0 2021-04-20 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> car 3.0-10 2020-09-29 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> carData 3.0-4 2020-05-22 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> cellranger 1.1.0 2016-07-27 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> cli 3.1.0 2021-10-27 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> clustermq 0.8.95.3 2022-01-26 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> codetools 0.2-18 2020-11-04 [2] CRAN (R 4.1.3)
#> colorspace 2.0-2 2021-06-24 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> crayon 1.4.1 2021-02-08 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> curl 4.3.2 2021-06-23 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> data.table 1.14.0 2021-02-21 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> DBI 1.1.2 2021-12-20 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> dbplyr 2.1.1 2021-04-06 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> desc 1.3.0 2021-03-05 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> devtools 2.4.2 2021-06-07 [1] CRAN (R 4.1.1)
#> digest 0.6.27 2020-10-24 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> dplyr * 1.0.7 2021-06-18 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> ellipsis 0.3.2 2021-04-29 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> evaluate 0.14 2019-05-28 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> extrafont * 0.17 2014-12-08 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> extrafontdb 1.0 2012-06-11 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> fansi 0.5.0 2021-05-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> fastmap 1.1.0 2021-01-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> forcats * 0.5.1 2021-01-27 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> foreign 0.8-82 2022-01-16 [2] CRAN (R 4.1.3)
#> fs 1.5.0 2020-07-31 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> furrr * 0.2.3 2021-06-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> future * 1.23.0 2021-10-31 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> generics 0.1.0 2020-10-31 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> ggplot2 * 3.3.5 2021-06-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> ggpubr * 0.4.0.999 2021-12-14 [1] Github (mattocci27/ggpubr@901fdeb)
#> ggsignif 0.6.3 2021-09-09 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> ggsma * 0.1.0 2021-07-01 [1] Github (mattocci27/ggsma@2b56c57)
#> globals 0.14.0 2020-11-22 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> glue 1.4.2 2020-08-27 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> gtable 0.3.0 2019-03-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> haven 2.4.1 2021-04-23 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> highr 0.9 2021-04-16 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> hms 1.1.0 2021-05-17 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> htmltools 0.5.1.1 2021-01-22 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> httr 1.4.2 2020-07-20 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> igraph 1.2.6 2020-10-06 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> janitor * 2.1.0 2021-01-05 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> jquerylib 0.1.4 2021-04-26 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> jsonlite 1.7.3 2022-01-17 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> kableExtra * 1.3.4 2021-02-20 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> knitr * 1.37 2021-12-16 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> lifecycle 1.0.0 2021-02-15 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> listenv 0.8.0 2019-12-05 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> lubridate 1.7.10 2021-02-26 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> magrittr 2.0.2 2022-01-26 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> memoise 2.0.0 2021-01-26 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> modelr 0.1.8 2020-05-19 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> munsell 0.5.0 2018-06-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> openxlsx 4.2.4 2021-06-16 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> parallelly 1.30.0 2021-12-17 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> patchwork * 1.1.1 2020-12-17 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> pillar 1.6.4 2021-10-18 [1] CRAN (R 4.1.1)
#> pkgbuild 1.2.0 2020-12-15 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> pkgconfig 2.0.3 2019-09-22 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> pkgload 1.2.1 2021-04-06 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> prettyunits 1.1.1 2020-01-24 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> processx 3.5.2 2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> ps 1.6.0 2021-02-28 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> purrr * 0.3.4 2020-04-17 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> R6 2.5.0 2020-10-28 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> Rcpp 1.0.8 2022-01-13 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> readr * 2.0.2 2021-09-27 [1] CRAN (R 4.1.1)
#> readxl 1.3.1 2019-03-13 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> remotes 2.4.0 2021-06-02 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> reprex 2.0.0 2021-04-02 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> rio 0.5.27 2021-06-21 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> rlang 0.4.11 2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> rmarkdown 2.11 2021-09-14 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> rprojroot 2.0.2 2020-11-15 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> rstatix 0.7.0 2021-02-13 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> rstudioapi 0.13 2020-11-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> Rttf2pt1 1.3.8 2020-01-10 [1] CRAN (R 4.1.3)
#> rvest 1.0.0 2021-03-09 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> sass 0.4.0 2021-05-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> scales 1.1.1 2020-05-11 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> sessioninfo 1.1.1 2018-11-05 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> smatr * 3.4-8 2018-03-18 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> snakecase 0.11.0 2019-05-25 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> stringi 1.6.2 2021-05-17 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> stringr * 1.4.0 2019-02-10 [1] CRAN (R 4.1.0)
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#> tarchetypes * 0.4.1 2022-01-07 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> targets * 0.10.0.9000 2022-02-05 [1] local
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#> tibble * 3.1.5 2021-09-30 [1] CRAN (R 4.1.1)
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#> tidyselect 1.1.1 2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)
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#> xfun 0.29 2021-12-14 [1] CRAN (R 4.1.2)
#> xml2 1.3.2 2020-04-23 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> yaml 2.2.1 2020-02-01 [1] CRAN (R 4.1.0)
#> zip 2.2.0 2021-05-31 [1] CRAN (R 4.1.0)
#>
#> [1] /opt/homebrew/lib/R/4.1/site-library
#> [2] /opt/homebrew/Cellar/r/4.1.3/lib/R/library
tar_visnetwork()
#> Loading required package: future
#> ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.1 ──
#> ✔ ggplot2 3.3.5 ✔ purrr 0.3.4
#> ✔ tibble 3.1.5 ✔ dplyr 1.0.7
#> ✔ tidyr 1.1.4 ✔ stringr 1.4.0
#> ✔ readr 2.0.2 ✔ forcats 0.5.1
#> ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
#> ✖ dplyr::filter() masks stats::filter()
#> ✖ dplyr::lag() masks stats::lag()