library(tidyverse)
library(targets)
library(kableExtra)

1 Leaf disc vs whole-leaf LMA (species-level)

1.1 Pooled

1.2 Seprated

2 SMA table (species-level)

tar_load(sma_tab)
sma_tab |>
  kable() |>
  kable_styling()
Data Slope Intercept R2
All 0.97 [0.94, 1.01] 0.09 [0.02, 0.16] 0.87
Thick~Large 0.93 [0.85, 1.03] 0.19 [0.01, 0.37] 0.86
Thick~Small 1.02 [0.97, 1.07] 0 [-0.11, 0.11] 0.93
Thin~Large 0.91 [0.82, 1.02] 0.2 [0.02, 0.37] 0.71
Thin~Small 0.93 [0.83, 1.03] 0.16 [-0.02, 0.35] 0.84

3 Leaf disc vs whole-leaf LMA (individual-level)

4 Divergence (species-level)

5 LMA and LD (species-level)

6 CV

7 Leaf support cost (species-level)

8 Computing Environment

devtools::session_info()
#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
#>  setting  value                       
#>  version  R version 4.1.3 (2022-03-10)
#>  os       macOS Monterey 12.3         
#>  system   aarch64, darwin21.3.0       
#>  ui       unknown                     
#>  language (EN)                        
#>  collate  en_US.UTF-8                 
#>  ctype    en_US.UTF-8                 
#>  tz       Asia/Shanghai               
#>  date     2022-04-06                  
#> 
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
#>  package     * version     date       lib source                            
#>  abind         1.4-5       2016-07-21 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  assertthat    0.2.1       2019-03-21 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  backports     1.2.1       2020-12-09 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  base64url     1.4         2018-05-14 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  broom         0.7.10      2021-10-31 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  bslib         0.2.5.1     2021-05-18 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  cachem        1.0.5       2021-05-15 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  callr         3.7.0       2021-04-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  car           3.0-10      2020-09-29 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  carData       3.0-4       2020-05-22 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  cellranger    1.1.0       2016-07-27 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  cli           3.1.0       2021-10-27 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  clustermq     0.8.95.3    2022-01-26 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  codetools     0.2-18      2020-11-04 [2] CRAN (R 4.1.3)                    
#>  colorspace    2.0-2       2021-06-24 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  crayon        1.4.1       2021-02-08 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  curl          4.3.2       2021-06-23 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  data.table    1.14.0      2021-02-21 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  DBI           1.1.2       2021-12-20 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  dbplyr        2.1.1       2021-04-06 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  desc          1.3.0       2021-03-05 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  devtools      2.4.2       2021-06-07 [1] CRAN (R 4.1.1)                    
#>  digest        0.6.27      2020-10-24 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  dplyr       * 1.0.7       2021-06-18 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  ellipsis      0.3.2       2021-04-29 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  evaluate      0.14        2019-05-28 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  extrafont   * 0.17        2014-12-08 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  extrafontdb   1.0         2012-06-11 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  fansi         0.5.0       2021-05-25 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  fastmap       1.1.0       2021-01-25 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  forcats     * 0.5.1       2021-01-27 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  foreign       0.8-82      2022-01-16 [2] CRAN (R 4.1.3)                    
#>  fs            1.5.0       2020-07-31 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  furrr       * 0.2.3       2021-06-25 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  future      * 1.23.0      2021-10-31 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  generics      0.1.0       2020-10-31 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  ggplot2     * 3.3.5       2021-06-25 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  ggpubr      * 0.4.0.999   2021-12-14 [1] Github (mattocci27/ggpubr@901fdeb)
#>  ggsignif      0.6.3       2021-09-09 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  ggsma       * 0.1.0       2021-07-01 [1] Github (mattocci27/ggsma@2b56c57) 
#>  globals       0.14.0      2020-11-22 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  glue          1.4.2       2020-08-27 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  gtable        0.3.0       2019-03-25 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  haven         2.4.1       2021-04-23 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  highr         0.9         2021-04-16 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  hms           1.1.0       2021-05-17 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  htmltools     0.5.1.1     2021-01-22 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  httr          1.4.2       2020-07-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  igraph        1.2.6       2020-10-06 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  janitor     * 2.1.0       2021-01-05 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  jquerylib     0.1.4       2021-04-26 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  jsonlite      1.7.3       2022-01-17 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  kableExtra  * 1.3.4       2021-02-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  knitr       * 1.37        2021-12-16 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  lifecycle     1.0.0       2021-02-15 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  listenv       0.8.0       2019-12-05 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  lubridate     1.7.10      2021-02-26 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  magrittr      2.0.2       2022-01-26 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  memoise       2.0.0       2021-01-26 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  modelr        0.1.8       2020-05-19 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  munsell       0.5.0       2018-06-12 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  openxlsx      4.2.4       2021-06-16 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  parallelly    1.30.0      2021-12-17 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  patchwork   * 1.1.1       2020-12-17 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  pillar        1.6.4       2021-10-18 [1] CRAN (R 4.1.1)                    
#>  pkgbuild      1.2.0       2020-12-15 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  pkgconfig     2.0.3       2019-09-22 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  pkgload       1.2.1       2021-04-06 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  prettyunits   1.1.1       2020-01-24 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  processx      3.5.2       2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  ps            1.6.0       2021-02-28 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  purrr       * 0.3.4       2020-04-17 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  R6            2.5.0       2020-10-28 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  Rcpp          1.0.8       2022-01-13 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  readr       * 2.0.2       2021-09-27 [1] CRAN (R 4.1.1)                    
#>  readxl        1.3.1       2019-03-13 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  remotes       2.4.0       2021-06-02 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  reprex        2.0.0       2021-04-02 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rio           0.5.27      2021-06-21 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rlang         0.4.11      2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rmarkdown     2.11        2021-09-14 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  rprojroot     2.0.2       2020-11-15 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rstatix       0.7.0       2021-02-13 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rstudioapi    0.13        2020-11-12 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  Rttf2pt1      1.3.8       2020-01-10 [1] CRAN (R 4.1.3)                    
#>  rvest         1.0.0       2021-03-09 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  sass          0.4.0       2021-05-12 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  scales        1.1.1       2020-05-11 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  sessioninfo   1.1.1       2018-11-05 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  smatr       * 3.4-8       2018-03-18 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  snakecase     0.11.0      2019-05-25 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  stringi       1.6.2       2021-05-17 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  stringr     * 1.4.0       2019-02-10 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  svglite       2.0.0       2021-02-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  systemfonts   1.0.4       2022-02-11 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  tarchetypes * 0.4.1       2022-01-07 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  targets     * 0.10.0.9000 2022-02-05 [1] local                             
#>  testthat      3.0.3       2021-06-16 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  tibble      * 3.1.5       2021-09-30 [1] CRAN (R 4.1.1)                    
#>  tidyr       * 1.1.4       2021-09-27 [1] CRAN (R 4.1.1)                    
#>  tidyselect    1.1.1       2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  tidyverse   * 1.3.1       2021-04-15 [1] CRAN (R 4.1.1)                    
#>  tzdb          0.1.2       2021-07-20 [1] CRAN (R 4.1.1)                    
#>  usethis       2.0.1       2021-02-10 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  utf8          1.2.1       2021-03-12 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  vctrs         0.3.8       2021-04-29 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  viridisLite   0.4.0       2021-04-13 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  webshot       0.5.2       2019-11-22 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  withr         2.4.2       2021-04-18 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  xfun          0.29        2021-12-14 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  xml2          1.3.2       2020-04-23 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  yaml          2.2.1       2020-02-01 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  zip           2.2.0       2021-05-31 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#> 
#> [1] /opt/homebrew/lib/R/4.1/site-library
#> [2] /opt/homebrew/Cellar/r/4.1.3/lib/R/library
tar_visnetwork()
#> Loading required package: future
#> ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.1 ──
#> ✔ ggplot2 3.3.5     ✔ purrr   0.3.4
#> ✔ tibble  3.1.5     ✔ dplyr   1.0.7
#> ✔ tidyr   1.1.4     ✔ stringr 1.4.0
#> ✔ readr   2.0.2     ✔ forcats 0.5.1
#> ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
#> ✖ dplyr::filter() masks stats::filter()
#> ✖ dplyr::lag()    masks stats::lag()